บรันเดล เซธ (เจฟฟ์ โกลด์บลุม) นักวิทยาศาสตร์หนุ่มอัจฉริยะ ได้สร้างเครื่องย้ายมวลสาร (Telepods) ขึ้น ที่สามารถส่งให้สิ่งหนึ่งย้ายไปอีกสิ่งหนึ่งได้สำเร็จอย่างอัศจรรย์ไม่ว่าจะเป็นสิ่งมีชีวิตใดๆ ท้ายที่สุด บรันเดลต้องทดลองกับตัวเอง แต่แล้วก็มีความผิดพลาดเกิดขึ้น เมื่อมีแมลงวันตัวหนึ่งเข้าไปในเครื่องขณะที่ตัวเขาทำการย้ายมวลสารตัวเอง ทำให้เซลล์ของแมลงวันผสมกับเซลล์ของบรันเดล โดยที่เขาไม่รู้ตัว
เรื่องราวเริ่มต้นเวลาหลายเดือนหลังจากภาพยนตร์เรื่องแรกที่มีการเกิดของมาร์ติน Brundle มาร์ตินจะไม่ซ้ำกันเป็นเขาเป็นลูกหลานของเวโรนิกา Quaife และ Seth Brundle คนที่กลายเป็นไฮบริดกลายพันธุ์ของมนุษย์และแมลงวันบ้าน (ที่รู้จักกันเป็น Brundlefly) จากภาพยนตร์เรื่องแรกที่ เกิดที่อยู่ภายใต้การควบคุมของนายจ้าง Brundle ของ Anton Bartok เจ้าของ Bartok อุตสาหกรรม (ซึ่งทุนการทดลอง teleportation Brundle s) เวโรนิกาเสียชีวิตระหว่างการคลอดบุตรออกจากมาร์ตินในความอารักขาของ Bartok ที่มีแผนจะใช้ประโยชน์จากสภาพที่ไม่ซ้ำกันของเขา
