Seth Brundle, een briljante maar excentrieke wetenschapper, geeft de journaliste Veronica Quaife de primeur voor zijn laatste uitvinden: een teleporter, waarmee materie verplaatst kan worden van de ene naar de andere plaats. Als hij zichzelf teleporteert vliegt er echter net een vlieg zijn capsule binnen.
Een paar maanden nadat Seth Brundle de dood vond door Veronica's geweer, baart zij zijn zoon, Martin. Seth's werkgever adopteert Martin, om zo zijn genen te kunnen gebruiken voor een superleger. Een paar jaar later is Martin volgroeid, ondanks dat hij pas vijf is, en de vlieg in hem begint wakker te worden. Met de hulp van zijn vriendin Beth probeert hij hulp te zoeken.
Een briljante wetenschapper raakt geobsedeerd door het perfectioneren van een apparaat dat dingen van de ene plek naar de andere kan verplaatsen. Na succesvolle tests, experimenteert hij met een menselijk proefkonijn - zichzelf.
Jean-Gab en Manu, twee eenvoudige vrienden, vinden een gigantische vlieg die vastzit in de kofferbak van een auto en besluiten hem te trainen om er geld mee te verdienen.
Vijftien jaar na het mislukte experiment van zijn vader, gaat Philippe Delambre samen met zijn oom François verder met het experimenteren. Maar het gaat fout en Phillipe verandert in een gruwelijk wezen, half mens en half vlieg...
Tijdens het filmen in Transsylvanië ontdekt een ploeg celluloidbeelden van de moord op een vrouw en ontketent de toorn van boze geesten.
