Kenshin Himura és un extraordinari guerrer samurai que viu enmig d'una societat en la que els guerrers ja no serveixen per res. Japó és a punt d'entrar en l'era del regnat de l'emperador Meiji, en ple canvi a la industrialització i la modernitat, i en el camí que Japó va emprendre per convertir-se en potència mundial. El protagonista és un dels pocs guerrers que queden, després que els samurais es perdessin en l'oblit. Algun dia, Kenshin va ser un gran mestre de l'espasa que lluitava en nombroses batalles, al costat d'un grup de patriotes. Ara només és un rodamón que va jurar no tornar a matar, i es dedica a ajudar a qui més ho necessita. Amb això es guanya l'afecte i el respecte de la gent. Passats ja 10 anys, al 1878, Kenshin arriba a Tòquio, on coneix en Kaoru, qui li ofereix quedar-se a viure en el seu dojo, el seu lloc de meditació. Tanmateix, l'antiga vida que Kenshin intenta deixar en el passat, tornarà per posar-se en contra seva.